Die Ursachen einer Parodontitis sind unterschiedlich. Als häufigste Ursache wird eine schlechte Mundhygiene und die damit verbundene Plaque genannt. Diese lagert sich am Zahnhals ab und wird durch die Mineralsalze des Speichles zu Zahnstein umgeformt. Bei weiterer Plaqueanlagerung wächst der Zahnstein und die Plaque wansert immer mehr in die Tiefe, wodurch die vorhandenen Bakterien eine Reizung des Zahnfleisches hervorrufen. Durch die Entzündung des Zahnfleisches kommt es zur Lockerung des Zahnhalteapparates. Ein weiteres Tiefenwachstum und weitere Entzündungen führen zu einer Zerstörung des umgebenen Zahnhalteapparates, wodurch eine Tasche entsteht. Im weiteren Verlauf kommt es zu einer Knochenzerstörung mit Zahnlockerung.

Weitere Faktoren wie Stress, Vererbung und Fehlbelastung können eine Parodontitis begünstigen.